電控學程

 控制系統(一)、控制系統(二)、電子學(二)

微算機導論、電動機械、電磁學、振動學、系統動態分析、邏輯設計與應用、機電整合控制程式設計*

線性系統理論、數位控制系統、非線性系統控制、生醫微系統、機器人學、數位訊號處理*、電子電路分析、微奈米系統之感測與致動*、最佳化控制*、數位電路分析與設計、聲學理論與應用*、電聲換能器*、聲學陣列信號處理*

奈微米學程

微機電系統導論、奈米科技與應用、振動學

微系統概論*、近代物理導論*、奈米材料與技術(材料系)、高等材料力學、有限單元法導論*、光機電系統設計、固態材料*

微奈米製造技術*、奈米結構力學*、微系統封裝設計與實驗*、微系統設計(工科系) 、微奈米系統之感測與致動*、奈米工程*、有限單元法、高等振動學*

能源學程

流體力學、能源工程、熱傳與質傳學

數值分析、空氣污染防治*、近代物理導論*、風力機系統設計*、線性代數（動機系）*、數值力學模擬*、車輛動力系統設計*

燃燒學一、層流理論、熱對流、數值流體力學、冷凍空調系統模擬與熱交換*、燃料電池*、生醫微熱流*、氣體動力學*、電子裝備冷卻系統*、微尺度熱流*、分子動力學*、噴射推進*、多尺度傳輸*、綠能專題*、高等微流體系統*

精密機械學程

控制系統(一)、光機電系統設計、電腦輔助設計製造

工程光學、機電整合控制程式設計、機械設計製造實習*、振動學、微機電系統導論、有限單元法導論*

精密機械設計一、精密機械設計二、高等機構學、可靠度設計*、製程診斷與分析*、凸輪學*、應用光學設計*、電腦輔助製造專題、製造技術專題